Компания SOE огорчила поклонников Matrix Online сообщением, что игра закончит свое существование 31-го июля 2009 года. Уже с 1-го июня разработчики прекратят взимать за нее плату и заниматься поддержкой конечных пользователей. Таким образом, на прощание с игрой ее фанатам выделено 2 месяца.
К моменту закрытия MxO исполнится 4 года и 4 месяца.